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農田水利會名稱變更沿革大致分為兩個時期：日據時期與光復後。光復後經過五次的區域調整及變更將水利組合確定為農田水利會。
水利之經營與管理
台灣農田水利事業，主要由農田水利會所負擔，由政府依不同時期經建計畫，透過農田水利會推動農田水利建設與經營管理。從台灣光復時農田水利設施因受戰爭破壞，農田荒廢，進步到一年四季均有穩定灌溉水源；從貧困到安定繁榮，進而扶助工業發展，塑造了台灣現今繁榮景象，農田水利會扮演的角色，功不可沒。
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光復前之農田水利經營與管理
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元代
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台灣農田水利事業之開端、台灣農業之開始及水利發展之淵源。
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明朝（天啟年間）
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招募漢人勞動者從事墾殖，從中抽取利益以經營台灣，而當時水利之興建已有相當規模。
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（永曆十五年）
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以導流灌田之法，積極改進農業，創設「埤」、「圳」，大興水利，從此台灣之水利與農業，漸就軌道。
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清代移民時
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頒發圳照及戳記，以保護該關團體，取締破壞。
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埤圳由住民獨立或共同合股設施，水租由埤圳主發出徵收單，農民以實物（稻穀）繳納，若水利設施規模較大，擁有多數之灌溉地者，於當地設水館，管理埤圳之修補灌溉用水之調節與徵收水租等工作。
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埤圳涉有圳頭或公鋤頭，管理用水或圳路修補。
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日本佔據台灣後
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殖民地的經營管制
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（民國前11年）
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頒佈「公共埤圳規則」𠘚Z有公共利害之埤圳，均指定為公共埤圳，賦予法人性格，由官方監督管理。
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（民國前4年）
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頒佈官設「埤圳規劃」㜊w對人民無力負擔水利工程，由官方直接興建經營。
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（民國10年）
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頒佈水利組合令。
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（民國11年）
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頒組合另施行細則𨫀N原有公共埤圳及官設埤圳逐漸改組為水利組合。
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（民國26年）
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全島共有大小水利組合109單位
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（民國31年）
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規定農田水利區域，並將區域內之私設埤圳強制編入水利組合。
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光復前夕
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台灣全島之水利組合為三十八個單位，水利組合下尚有實行小組之建立，以負責管理小給水路與小排水路。
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1.農田水利協會、農田水利委員會時期（民國34∼44年）
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民國34年（1945）
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依水利法之規定將當時三十八個水利組合改組為農田水利協會
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民國36年7月1日
（1947）
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台灣省政府成立，將原農林處提升後之農田水利局與原屬公共工程局下之河川組合併為台灣省政府建設廳水利局，主管農田水利業務之監督輔導。
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民國37年1月13日
（1948）
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頒「台灣省各地水利委員會設置辦法」
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民國40年（1951）
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修正「台灣省各地水利委員會設置辦法」
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2.農田水利會時期（民國44∼63年）
台灣省政府成立專案小組研議決定針對水利委員會在組織體制、制度管理及業務經營上種種缺失，予以徹底、具體的全面改進。首先修訂相關基本法規，在水利法中明訂農田水利會的自治團體，賦予公法人性格，並頒佈「台灣省農田水利會組織規程」；消極的除弊與積極的興力同時並行，確立農田水利會之法定地位，並實施區域調整，健全組織體制，樹立完善制度，強化基層組織，釐定收費標準，建立財物制度，籌措周轉基金及明訂監督輔導責任。
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民國45年（1956）
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將40個水利委員會調整合併成26個農田水利會。
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民國51年（1962）
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頒佈「台灣省農田水利會組織規程」。
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民國54年（1965）
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頒佈「農田水利會組織通則」。
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3.健全農田水利會時期（民國64∼71年）
民國五十年代以來，國家社會穩定發展，各項水利建設積極興修的結果，我國農業生產日增；但隨著產業轉型，社會經濟結構變更，農民收益相對無法合理增加，致水利會會費農民負擔感到沈重；而水利會因配合政府減輕農民負擔等政策，水利工程及灌溉管理營運經費日行短絀；台灣省政府為督促水利會，先後頒行「水利會業務改進方案」及「農田水利會整頓方案」，但實施結果，因人謀不臧及辦理水利會有關選舉為地方派系介入以及財物不健全等因素，績效有限。民國64年1月1日，實施「台灣省加速農村建設時期健全農田水利會實施要點」，連續七年來由於目標正確，加上有關單位之密切配合，以及水利會工作人員努力，會員通力合作，才能收到預期效果，為農田水利會奠下良好的營運基礎。
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民國61年（1972）
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頒佈「加速農村建設重要措施」
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民國64年1月1日（1975）
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實施「台灣省加速農村建設時期健全農田水利會實施要點」
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4.改進農田水利會時期（民國71年以後迄今）
七十年代政府對農田水利事業以維持現狀為原則，不再做大規模之投資建設。而農田水利會恢復會長、會員代表之選舉，受此期間台灣社會解除戒嚴和黨禁，民主意識高漲，傳統上在農村社會之政治活動佔有一席之地之農田水利會，更以自治團體自居，多少影響農田水利事業營運管理，同時水利會員工薪資和水利設施維護人工、材料等價格高漲，使得水利會之營運在健全方案後四、五年內逐漸又陷入困境。
政府雖然增加工程費之補助成數，最後甚至全額補助工程費，仍無法解決農田水利會營運上之財務困難。同時農民之純農業收益降低之情形下，也對繳納農田水利會會費意願低落。因此水利會經歷七十一年、七十五年、七十九年、三屆選舉後，經政府徵詢各方意見後，而八十二年在修正農田水利會組織通則部分條文，此項重大改革，冀期農田水利會為地方農田水利事業專業團體，繼續對農田水利事業扮演重要角色。
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