技術研發與應用服務：
•現代化水文觀測技術引進與應用評估。
•水文觀測與資料品管標準作業程序研究。
•水文、水資源分析方法及標準規範研析。
•水資源科學管理方法與策略規劃研析。
•多元化水資源整體經營與流域治理規劃。
•研訂水文、水資源相關技術手冊及教育訓練課程。
•發行水文通訊、水資源情勢等相關刊物。
農田水利綜合企劃服務：
• 目前農業環境，分析未來水資源之發展趨勢，協助規劃農田水利經營之方針。
• 協助推動農田水利新興科技產業之發展與研發。
• 針對重要農田水利業務，企劃政策與法制作業服務。
• 農田水利會會務查核及標準作業程序研擬。
• 農田水利基本資料彙整、分析及加值應用。
政策推廣與資訊服務：
• 辦理水資源相關研討會議與時勢圓桌論壇，彙整水資源專家輿論。
• 辦理政策說明會與成果發表會等與民眾交流，推展公共事務。
• 規劃及辦理地層下陷防治專業技術訓練課程與種子教師培訓。
• 結合民間力量共同參與政府水資源保育工作。
• 發行水資源新聞電子報及水資源新知蒐錄，提供水相關資訊流通服務。
• 整合水資源相關資料庫運用及知識庫平台建構，提供水知識倉儲服務。
• 建置水資源資訊服務網站與數位學習規劃，提供水智慧交流服務。
政策企劃服務：
• 掌握國內外水資源政策發展趨勢，協助進行水資源政策評估與分析工作。
• 建置水資源政策分析基本資料庫，提供政策評估與分析之依據。
• 協助引進國內外政策評估技術。
• 培養水資源政策分析人才、傳授政策分析知識與技能。
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